令和２年３月２５日判決言渡
平成３１年（行ケ）第１００１９号審決取消請求事件（以下「第１事件」という。）同第１００３０号審決取消請求事件（以下「第２事件」という。）
口頭弁論終結日令和２年２月３日
判決
第１ 事件原告シージェイジャパン株式会社
第２ 事件原告シージェーチェイルジェダンコーポレーション
上記両名訴訟代理人弁護士飯村敏明
末吉剛
上記両名訴訟復代理人弁護士髙橋聖史
上記両名訴訟代理人弁理士山本修
鶴喰寿孝
第１・２事件被告味の素株式会社
（以下「被告」という。）
同訴訟代理人弁護士森﨑博之
津城尚子
同訴訟代理人弁理士白石真琴
同訴訟復代理人弁理士北谷賢次
主文
１ 原告らの請求をいずれも棄却する。
２ 訴訟費用は原告らの負担とする。
３ 第２事件原告について，この判決に対する上告及び上告受理申立てのた
めの付加期間を３０日と定める。
事実及び理由
第１ 請求
特許庁が無効２０１７－８０００２２号事件について平成３１年１月８日にした
審決を取り消す。
第２ 事案の概要
本件は，特許無効審判請求に対する不成立審決の取消訴訟である。争点は，サポ
ート要件及び実施可能要件違反の有無，進歩性の有無並びに明確性要件違反の有無
である。
１ 手続の経緯
(1) 被告は，名称を「Ｌ－グルタミン酸生産菌及びＬ－グルタミン酸の製造方法」とする発明について，平成１７年１２月２８日（以下「本件出願日」という。），特許出願をし（優先権主張：平成１７年９月９日［以下「本件優先日」という。］，優先権主張国：日本国），平成２５年８月２３日，その特許権の設定登録（特許第５３４３３０３号）を受けた（以下「本件特許」という。）。
(2) 第１事件原告は，平成２９年２月２４日に本件特許の無効審判請求（無効２０１７－８０００２２号）をし，第２事件原告が同審判に参加した。同審判手続に
おいて，被告は，平成２９年７月７日付け訂正請求書（甲３９，甲３９の２・３）
で，請求項３を削除することを含む訂正請求（以下「本件訂正」という。）をした。特許庁は，本件訂正を認めた（以下，訂正後の明細書及び図面を併せて「本件明
細書」という。）上，平成３１年１月８日，「特許第５３４３３０３号の請求項１，２及び４～１２に係る発明についての審判請求は，成り立たない。特許第５３４３
３０３号の請求項３に係る発明についての審判請求を却下する。」との審決（以下
「本件審決」という。）をし，本件審決の謄本は，同月１８日に原告らに送達された。
２ 発明の要旨
本件訂正後の本件特許の請求項１，２，４～１２（甲３９の２，以下，請求項の
番号に従い「本件発明１」などといい，併せて「本件発明」という。）は，次のとおりのものである。
【請求項１】Ｌ－グルタミン酸生産能を有するコリネ型細菌であって，
変異型ｙｇｇＢ遺伝子が導入されたことにより非改変株と比較してＬ－グルタミン
酸生産能が向上したコリネ型細菌であって
前記変異型ｙｇｇＢ遺伝子は，（ｉ），（ｉ’），（ｉ’’）または（ｉｉ）の
変異が導入された，コリネ型細菌：
（ｉ）配列番号６，６８，８４もしくは８５のアミノ酸配列のアミノ酸番号４
１９－５３３の領域もしくは配列番号６２のアミノ酸番号４１９－５２９の領域の
欠失，
（ｉ’）配列番号６，６８，８４もしくは８５のアミノ酸配列のアミノ酸番号
４１９－５３３の領域もしくは配列番号６２のアミノ酸番号４１９－５２９の領域
へのインサーションシーケンス又はトランスポゾンの挿入，
（ｉ’’）配列番号６，６８，８４もしくは８５のアミノ酸配列のアミノ酸番
号４１９－５３３の領域もしくは配列番号６２のアミノ酸番号４１９－５２９の領
域に存在するプロリンを他のアミノ酸に置換する変異，
または
（ｉｉ）配列番号６，６２，６８，８４もしくは８５のアミノ酸配列のアミノ
酸番号１－２３，８６－１０８，及び１１０－１３２からなる群から選ばれる領域
における１～５個のアミノ酸の置換，欠失，又は挿入。
【請求項２】前記（ｉ’’）の変異は，配列番号６，６２，６８，８４もしくは８
５のアミノ酸配列において，４２４位のプロリンをアラニン，グリシン，バリン，
ロイシン，及びイソロイシンからなる群から選ばれる１個のアミノ酸に置換し，及
び／または４３７位のプロリンをスレオニン，セリン及びチロシンからなる群から
選ばれる１個のアミノ酸に置換する変異である，請求項１に記載のコリネ型細菌。
【請求項４】Ｌ－グルタミン酸生産能を有するコリネ型細菌であって，
変異型ｙｇｇＢ遺伝子が導入されたことにより非改変株と比較してＬ－グルタミン
酸生産能が向上したコリネ型細菌であって，
前記変異型ｙｇｇＢ遺伝子の変異は，配列番号６，６２，６８，８４もしくは８
５のアミノ酸配列において，１００位のアラニンをスレオニンに，及び／または１
１１位のアラニンをスレオニンもしくはバリンに置換する変異である，コリネ型細
菌。
【請求項５】Ｌ－グルタミン酸生産能を有するコリネ型細菌であって，
変異型ｙｇｇＢ遺伝子が導入されたことにより非改変株と比較してＬ－グルタミン
酸生産能が向上したコリネ型細菌であって，
前記変異型ｙｇｇＢ遺伝子の変異は，配列番号６，６２，６８，８４もしくは８
５のアミノ酸配列において，１４位のロイシンと１５位のトリプトファンの間に１
～５アミノ酸を挿入する変異である，コリネ型細菌。
【請求項６】前記変異型ｙｇｇＢ遺伝子が，下記（ａ）～（ｎ）より選ばれる変異
型ｙｇｇＢ遺伝子である請求項１，２，４及び５のいずれか一項に記載のコリネ型
細菌：
（ａ） 配列番号８のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｂ） 配列番号８のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，欠
失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリネ
型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該コ
リネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｃ） 配列番号２０のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｄ） 配列番号２０のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｅ） 配列番号２２のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｆ） 配列番号２２のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｇ） 配列番号２４のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｈ） 配列番号２４のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｉ） 配列番号６４のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｊ） 配列番号６４のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｋ） 配列番号７０のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｌ） 配列番号７０のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｍ） 配列番号７４のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｎ） 配列番号７４のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
【請求項７】前記変異型ｙｇｇＢ遺伝子の導入により，Ｌ－グルタミン酸アナログ
耐性が向上したことを特徴とする，請求項１，２及び４～６のいずれか一項に記載
のコリネ型細菌。
【請求項８】さらに（ｉ）のｓｙｍＡ遺伝子が不活化するように改変された，請求
項１，２及び４～７のいずれか一項に記載のコリネ型細菌。
（ｉ） 配列番号８６の塩基番号５８５～１１２１の塩基配列を含むＤＮＡ。
【請求項９】さらにα－ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼ活性が低下するように改
変された，請求項１，２及び４～８のいずれか一項に記載のコリネ型細菌。
【請求項１０】コリネバクテリウム属またはブレビバクテリウム属に属する，請求
項１，２及び４～９のいずれか一項に記載のコリネ型細菌。
【請求項１１】請求項１，２及び４～１０のいずれか一項に記載のコリネ型細菌を
培地で培養し，Ｌ－グルタミン酸を該培地中に生成蓄積させ，該培地からＬ－グル
タミン酸を回収することを特徴とするＬ－グルタミン酸の製造法。
【請求項１２】下記（ａ）～（ｎ）より選ばれる変異型ｙｇｇＢ遺伝子：
（ａ） 配列番号８のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｂ） 配列番号８のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，欠
失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリネ
型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該コ
リネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｃ） 配列番号２０のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｄ） 配列番号２０のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｅ） 配列番号２２のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｆ） 配列番号２２のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｇ） 配列番号２４のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｈ） 配列番号２４のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｉ） 配列番号６４のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｊ） 配列番号６４のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｋ） 配列番号７０のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｌ） 配列番号７０のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（ｍ） 配列番号７４のアミノ酸配列をコードするＤＮＡ，
（ｎ） 配列番号７４のアミノ酸配列において，１～５個のアミノ酸が置換，
欠失，挿入もしくは付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし，コリ
ネ型細菌に導入することにより，過剰量のビオチンを含む培地で培養したときの該
コリネ型細菌のＬ－グルタミン酸生産能を向上させるＤＮＡ。
（長文のため、ここでは本文の冒頭のみを掲載しています。全文はこのページの表示後に読み込まれます。原本は原本PDFをご覧ください。）
出典：裁判所ウェブサイト「裁判例検索」（https://www.courts.go.jp/hanrei/89439/detail7/index.html）。本文は同サイト掲載の判決書PDFからTaiLexi AIがテキスト化・整形したもの（正確な文言は原本PDFを参照）。判示事項・裁判要旨・参照法条は裁判所の公表どおり。